Probabilmente da fagotto “involto", ma anche “persona che si comporta e si veste in modo goffo", parola di origine francese che è attestata in italiano solo dall’inizio del XVI secolo (lo strumento musicale dall’identico nome è attestato in italiano dal 1585). De Felice 1978 include questo cognome tra quelli derivati da faggio, il noto albero. Si trova soprattutto a Portogruaro e, secondariamente a Gruaro, Cinto Caomaggiore e Pordenone (qui anche come Fagotti).